Nature: 抗體試劑的過失
Nature: 抗體試劑的過失
抗體是生命科學(xué)中最常用的工具，但目前看來也是最常出現(xiàn)問題的。這篇文章不僅討論了目前抗體試劑的現(xiàn)狀與導(dǎo)致的問題，并且呼吁科學(xué)家們應(yīng)該重視起來，對訂購的抗體試劑要保持懷疑并測試有效性。
抗體是生命科學(xué)中最常用的工具，用于鑒定、分離蛋白，但目前看來也是最常出現(xiàn)問題的。不同批次抗體之間的差別可能會導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的巨大差異。而且抗體除了識別檢測的蛋白外，還經(jīng)常被其他蛋白識別，從而導(dǎo)致項(xiàng)目失敗，造成時間、金錢和樣品的浪費(fèi)。
很多人都認(rèn)為抗體可以解釋大多數(shù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果無法重復(fù)的問題。美國賓夕法尼亞州莫爾文市的醫(yī)藥公司TetraLogic Pharmaceuticals的首席科學(xué)官 Glenn Begley說，特征不明顯的抗體比實(shí)驗(yàn)室其他工具更容易出現(xiàn)問題，他在一篇爭議性分析中說，53個腫瘤標(biāo)志物研究論文中有47個無法重復(fù)出實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
有糟糕的抗體經(jīng)歷的幾個科學(xué)家把這個問題提了出來。其中就包括耶魯大學(xué)病理學(xué)家David Rimm，他曾用抗體開發(fā)了指導(dǎo)黑色素瘤治療的診斷試劑，用幾種聯(lián)合的Y型大分子對活體組織染色，就能知道病人是否需要進(jìn)一步的治療以阻止術(shù)后復(fù)發(fā)。但資金投入大批抗體生產(chǎn)后，這批新抗體無法重復(fù)之前的結(jié)果，Rimm被迫停止了這個項(xiàng)目。 他寫綜述、開網(wǎng)絡(luò)研討會、在無數(shù)會議中提出這個問題。這些科學(xué)家們推動建立抗體生產(chǎn)、使用、描述的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)程，提出了一些評估抗體質(zhì)量的好方法。但時間太短了難以產(chǎn)生巨大影響，“資源都在那卻沒人用，很多人甚至不知道”，全球生物標(biāo)準(zhǔn)機(jī)構(gòu)首腦Len Freedman說，“許多供應(yīng)商并不想改變現(xiàn)有產(chǎn)品，雖然很多抗體試劑特別爛”。
加拿大多倫多西奈山醫(yī)院的蛋白組學(xué)的研究人員Ioannis Prassas，他與同事一直進(jìn)行關(guān)于CUZD1蛋白的研究。他們認(rèn)為這個蛋白可以用于診斷胰腺癌。他們買的蛋白檢測試劑盒，花了兩年時間、50萬美元，上千份病人樣本時候才意識到這個試劑盒上出了問題。試劑盒的抗體識別另一個腫瘤蛋白CA125，根本不識別CUZD1！Prassas回顧時說：“急于求證一個有希望的假設(shè)讓大家忘了做檢測。”好多買抗體的科學(xué)家都相信在管子上印的標(biāo)簽，不知道確認(rèn)抗體有效性，只知道訂購它們。科學(xué)家們應(yīng)該警覺起來，“抗體不是魔法試劑，你不能就把它們?nèi)拥侥愕臉悠飞希竿贸龅慕Y(jié)果百分百有效”。
抗體是脊椎動物免疫系統(tǒng)產(chǎn)生的，可以抵抗入侵者，如細(xì)菌。將目的蛋白注射給一只兔子，B細(xì)胞就會產(chǎn)生針對這種蛋白的抗體，收集兔子的血液就能獲得抗體。將B細(xì)胞永生化并培養(yǎng)就能有源源不斷的抗體供應(yīng)。30年前需要用抗體做實(shí)驗(yàn)的科學(xué)家需要自己做，在90年代末，試劑公司開始接管這類雜事。而現(xiàn)在有超過300家公司銷售，種類超過200萬.2011年市值16億美元。但只有不到一半能在組織切片中觀察到蛋白分布，這讓一些科學(xué)家認(rèn)為不到一半的商業(yè)抗體都不可靠。
科學(xué)家們抱怨最多的是公司不提供評估抗體特異性所需的數(shù)據(jù)，和批次之間的差別。而公司的產(chǎn)品特性描述都是從上批產(chǎn)品直接抄過來的，提供的數(shù)據(jù)也往往是理想條件下做出的，不代表常規(guī)試驗(yàn)。抗體公司回應(yīng)說，他們不可能所有試驗(yàn)條件都測試，但他們提供可靠數(shù)據(jù)，并與科學(xué)家共同提高抗體質(zhì)量。有些科學(xué)家買不同供應(yīng)商的抗體試驗(yàn)中比較一下哪個實(shí)驗(yàn)結(jié)果最好，但最終他們買到的是不同地方生產(chǎn)的抗體。大供應(yīng)商們相互競爭，經(jīng)常從小供應(yīng)商買來抗體重新貼上標(biāo)簽進(jìn)行銷售。
Trimer希望這個問題有個正向反饋環(huán)，當(dāng)更多科學(xué)家意識到這個問題，就會懷疑并披露更多不合格試劑，使抗體質(zhì)量慢慢改進(jìn)。
轉(zhuǎn)載自：生物谷