95%的人類基因組并不編碼基因，而是產生大量的非編碼RNA，真正編碼蛋白質的基因只占人類總基因組的約2%。這些非編碼RNA在生長發育的各個階段都發揮著重要的調節作用，與艾滋病、白血病、糖尿病、畸形等多種病變密切相關，并且參與著干細胞和表觀遺傳學調控。RNA結合蛋白（RBPs）通過細胞核或細胞質中的RNA識別基序（RRM）或者RNA結合區（RBD）來結合RNA，這種結合作用取決于RBP的類型和所結合的RNA序列。而RNA-蛋白復合物驅動了幾乎所有細胞過程的基因表達的轉錄后調控，包括剪接（splicing）、出核轉運（nuclear export）、mRNA 穩定性以及蛋白轉譯過程。因此，對基因調控的了解就有賴于確定這些過程中RNA的結合的變化，RNA研究也被越來越多的科學家重視。RIP技術逐漸成為RNA研究領域的一項常規方法，特別是轉錄后調控網絡；同樣也是研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具。

RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助發現miRNA的調節靶點。RIP技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析。RIP是染色質免疫沉淀ChIP技術的類似應用，但由于研究對象是RNA-蛋白復合物而不是DNA-蛋白復合物，RIP實驗的優化條件與ChIP實驗不太相同（如復合物不需要固定，RIP反應體系中的試劑和抗體絕對不能含有RNA酶，抗體需經RIP實驗驗證等）。RIP技術下游結合microarray技術被稱為RIP-Chip，更高通量地了解癌癥以及其它疾病整體水平的RNA變化。

RIP用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白，RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來，結合的RNA序列再通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或高通量測序（RIP-Seq）方法來鑒定 。

首先對細胞進行裂解；在裂解液中加入抗體及蛋白A/G磁珠，接著用磁極固定磁珠復合物，并洗脫未結合的蛋白-RNA復合物；提取蛋白-RNA中的RNA，純化后進行下游實驗，如qRT-PCR，微陣列（RIP-Chip）、高通量測序（RIP-Seq）等。

RIP的一大優勢在于，通過MS（質譜技術），RIP可以同時鑒定RNPs中的蛋白組分和其相關聯的調控蛋白。環境條件的改變或者在細胞分化過程中，RNP復合物會發生重塑，而RNA mapping和MS技術可以對這種重塑進行檢測。

作為表觀遺傳學研究的領軍者，默克密理博（Merck Millipore）總結了其在研究DNA與蛋白相互作用的經驗，推出了用于研究RNA與蛋白相互作用的試劑盒（RIP?試劑盒、目錄號：17-700、17-701）以及其他一系列相關產品，為該研究領域的飛速發展提供了便利的條件。